Il campione in carica ha preceduto il pilota Honda Johann Zarco di 0.140 secondi, mentre Fabio Di Giannantonio ha chiuso terzo, staccato di oltre un secondo dal tempo di Marquez, che ha fermato il cronometro sull'1'48"087 in sella alla sua Ducati.
Il fratello di Marc, Alex Marquez, era stato il più veloce nelle prove libere di venerdì, ma non è riuscito a ripetersi in qualifica ed è caduto alla curva nove; nonostante ciò, è riuscito a risalire fino al quinto posto.
Lo spagnolo partirà dalla seconda fila insieme al leader della classifica generale, il pilota Aprilia Racing Marco Bezzecchi e al pilota KTM Pedro Acosta.
"Ieri sull’asciutto penso che Alex fosse un passo avanti a tutti, poi noi altri eravamo lì, più o meno sullo stesso livello," ha dichiarato Marc Marquez a DAZN.
"Invece sul bagnato, in condizioni in cui bisogna essere più fluidi, senza esagerare troppo e senza spingere al massimo, è lì che mi sento più a mio agio."
Per Marc Marquez si tratta della prima pole dal Gran Premio d'Ungheria nell’agosto 2025.
Jorge Martin e Fermin Aldeguer sono caduti anche loro nelle difficili condizioni della pista, mentre altri piloti come Franco Morbidelli e Jack Miller erano già finiti a terra nella Q1.
La gara sprint a Jerez si disputerà più tardi, sempre sabato.